克斯这个间谍在偷取T病毒的时候，故意打碎了一管T病毒原液，他不知道就是因为他手贱的操作，导致了世界末日。

被打碎的T病毒原液和空气混合被吸入了通风管道中，当地下实验室的人工智能红后反应过来的时候，T病毒已经随着通风管道遍布了整个地下实验室，里面所有的科学家、研究员、保安、后勤人员都感染了T病毒。

而地下实验室蜂巢的人工智能红后为了防止T病毒继续扩散，照成难以想象的后果，根据程序设定，它做出了一个可怕的决定。

那就是封闭整座地下实验室，然后把地下实验室中的所有人全部杀光，以防止他们乱跑，会把病毒带到外界去。

可惜红后的良苦用心并没有人了解，保护伞给公司还以为是人工智能红后失控了，于是他们派出了一队雇佣兵前往地下实验室蜂巢，去取回人工智能红后的主板。

随着雇佣兵打开了地下实验室蜂巢的大门，潘多拉的盒子被打开了，生化危机第一部的剧情也就此展开。